More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00501 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  100 
 
 		 369 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  96.75 
 
 		 369 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  95.66 
 
 		 369 aa  699    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  75.72 
 
 		 367 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  53.28 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.46 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  56.32 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  52.72 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.46 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  50.14 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 379 aa  255  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  38.1 
 
 		 652 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  37.68 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  35.86 
 
 		 666 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  35.57 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  35.16 
 
 		 652 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  33.7 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  32.21 
 
 		 684 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  55.03 
 
 		 149 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  33.16 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  29.46 
 
 		 1033 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.3 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.22 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.57 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.03 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.76 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.76 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.76 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.49 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.99 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.09 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.95 
 
 		 411 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  26.86 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.53 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29.43 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  26.39 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  26.63 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 		 375 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.53 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  26.79 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  25.27 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  26.3 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25.57 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.84 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  23.75 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  25.92 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.94 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  31.55 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.88 
 
 		 417 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  23.76 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.07 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.74 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  25.57 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  25.57 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  22.44 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  24.04 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  24.47 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  22.81 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.16 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  25.7 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  25.73 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.22 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  24.24 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.22 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.22 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>