More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2502 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
454 aa  880    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  67.11 
 
 
450 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  41.51 
 
 
382 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  42.96 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  43.68 
 
 
372 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  41.75 
 
 
384 aa  236  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  40.33 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  37.47 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.05 
 
 
391 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  39.95 
 
 
388 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  40.1 
 
 
375 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  40.39 
 
 
393 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  41.23 
 
 
392 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  43.44 
 
 
368 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  39.7 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  39.23 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  41.81 
 
 
389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.37 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.45 
 
 
356 aa  193  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  37.41 
 
 
349 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  33.18 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  34.11 
 
 
440 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  35.19 
 
 
371 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  33.87 
 
 
411 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  35.46 
 
 
406 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  39.55 
 
 
389 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  35 
 
 
375 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.04 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.47 
 
 
401 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.76 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  34.62 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  33.25 
 
 
342 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  32.27 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  32.34 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.17 
 
 
340 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.63 
 
 
1033 aa  113  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  29.9 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.55 
 
 
371 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
379 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.94 
 
 
376 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 
652 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 
368 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  33.83 
 
 
338 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  33.83 
 
 
338 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  33.83 
 
 
338 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.48 
 
 
367 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 
666 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  32.41 
 
 
376 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  33.5 
 
 
342 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.68 
 
 
375 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  32.18 
 
 
376 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 
666 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.06 
 
 
369 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
325 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.49 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.61 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  26.91 
 
 
652 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.57 
 
 
369 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 
361 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
376 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.25 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.06 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.06 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.76 
 
 
369 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.75 
 
 
369 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.46 
 
 
365 aa  89.7  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.67 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  27.85 
 
 
684 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.26 
 
 
369 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.26 
 
 
369 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
360 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
375 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 
325 aa  86.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.02 
 
 
369 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.33 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.26 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  31.06 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  23.06 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  23.06 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  28.4 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.29 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.14 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  30.63 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  27.59 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.3 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.63 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>