More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10420 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  100 
 
 		 340 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  80 
 
 		 338 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  76.2 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  76.2 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  76.2 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  77.58 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  48.82 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  47.9 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  49.85 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  41.62 
 
 		 375 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  43.64 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  41.64 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  42.01 
 
 		 385 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  38.23 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  38.53 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.42 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  36.41 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  40.56 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  36.03 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  38.11 
 
 		 393 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  37.9 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  35.98 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  40.78 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  34.52 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  34.36 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  38.52 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  34.25 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.66 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  32.62 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  32.91 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  34.81 
 
 		 652 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  37.64 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.28 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  33.17 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  33.91 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  35.44 
 
 		 401 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  35.24 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  34.35 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  33.23 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  33.64 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  32.84 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  33.75 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  33.75 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  31.93 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 368 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.53 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  33.13 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  34.09 
 
 		 406 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  32.09 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.93 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  32.24 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  32.01 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.85 
 
 		 1033 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  36.65 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  36.78 
 
 		 389 aa  99.4  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  45.75 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  28.2 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.49 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.15 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  32.64 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  34.04 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.64 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  33.9 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  30.37 
 
 		 666 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.88 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  34.32 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  30.64 
 
 		 652 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  26.01 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  32.05 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  26.01 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  30.06 
 
 		 666 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 		 376 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  25.14 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.62 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  30.18 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 372 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.75 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>