211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1748 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
340 aa  700    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  100 
 
 
340 aa  700    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  50.44 
 
 
356 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  49.86 
 
 
356 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  49.85 
 
 
354 aa  322  4e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 
350 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 
353 aa  290  3e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  43.8 
 
 
393 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 
378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 
372 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  40.46 
 
 
355 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
353 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.57 
 
 
394 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
410 aa  275  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 
374 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
374 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
374 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 
358 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  42.9 
 
 
377 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 
365 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  42.3 
 
 
377 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  42.3 
 
 
377 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  42.3 
 
 
377 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  42.3 
 
 
377 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  42.3 
 
 
377 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  42.3 
 
 
377 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  40.6 
 
 
377 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  43.21 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
376 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  41.72 
 
 
360 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  41.19 
 
 
379 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
378 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
378 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  40.06 
 
 
376 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
378 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 
378 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
381 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
381 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
378 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 
378 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  36.98 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
402 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 
338 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  37.2 
 
 
369 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  39.17 
 
 
338 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
338 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  37.28 
 
 
338 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  37.87 
 
 
339 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
368 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  38.97 
 
 
337 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  37.88 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  38.46 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  38.46 
 
 
334 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  36.39 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  36.84 
 
 
330 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  35.95 
 
 
316 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  37.24 
 
 
325 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  37.76 
 
 
334 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  37.08 
 
 
316 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  35.36 
 
 
324 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
325 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  26.84 
 
 
375 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.2 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.93 
 
 
388 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  27.73 
 
 
342 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.43 
 
 
374 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.56 
 
 
405 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 
371 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  25.7 
 
 
391 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.89 
 
 
440 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  26.29 
 
 
335 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  29.03 
 
 
360 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 
411 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  24.56 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  26.75 
 
 
349 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.1 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  26.01 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  27 
 
 
398 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  24.79 
 
 
393 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  24.35 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  26.69 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  24.36 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  23.06 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  26.89 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  24.31 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  24.4 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  25.87 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  22.89 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>