More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3378 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  92.27 
 
 		 375 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  96.27 
 
 		 375 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  90.13 
 
 		 375 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  97.6 
 
 		 375 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  93.07 
 
 		 375 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  97.6 
 
 		 375 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  81.94 
 
 		 377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  81.23 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  81.23 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  80.97 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  80.32 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  80.32 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  79.68 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  68.41 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  68.49 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  64.53 
 
 		 368 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  59.13 
 
 		 374 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  57.61 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  56.68 
 
 		 375 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  50.29 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  57.68 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  54.14 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  33.03 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.26 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.53 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.62 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.26 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.53 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.53 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.53 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.53 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.53 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.7 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.18 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.58 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.6 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.38 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.63 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 984 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.75 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.89 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.2 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.23 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  28.25 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 411 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  32.2 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 983 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.11 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 441 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.26 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.83 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.32 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 411 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  32.42 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  27.13 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.91 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.6 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  26.77 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.22 
 
 		 418 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  30.4 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  31.12 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  29.39 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.3 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.87 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  26.75 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 960 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.91 
 
 		 429 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.77 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>