More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0573 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
390 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 
385 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
383 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  51.77 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 
371 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  48.86 
 
 
378 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  49.57 
 
 
378 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  47.03 
 
 
356 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  46.98 
 
 
378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  43.68 
 
 
378 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
376 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  42.49 
 
 
364 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
375 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
369 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  38.86 
 
 
365 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  36.68 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  37.67 
 
 
380 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.17 
 
 
440 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.17 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.62 
 
 
369 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 
369 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.62 
 
 
369 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.62 
 
 
369 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.62 
 
 
369 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.91 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.74 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.33 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.33 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
983 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
984 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.27 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
361 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 
382 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
393 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.2 
 
 
410 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 
372 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.44 
 
 
405 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  31.08 
 
 
406 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.35 
 
 
401 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 
402 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
394 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.14 
 
 
404 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
387 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  24.81 
 
 
391 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.57 
 
 
363 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  29.19 
 
 
368 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.24 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.81 
 
 
391 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.81 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.81 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.57 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.23 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.23 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
492 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
365 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
419 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  24.6 
 
 
330 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.45 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.54 
 
 
393 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.56 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
496 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.73 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
500 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.79 
 
 
371 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
444 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
375 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
455 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
375 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
444 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.09 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>