More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0271 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 373 aa  766    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  65.25 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  45.23 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  46.13 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 492 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 496 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.88 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.9 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 823 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 816 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 816 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  29.19 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.45 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 806 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.18 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.38 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 825 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  28.23 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.23 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.44 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.77 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.72 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.76 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 799 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.27 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.61 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 805 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.27 
 
 		 417 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.72 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 815 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 817 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 831 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  28.91 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  28.91 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 815 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 815 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>