More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4343 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  67.2 
 
 		 375 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 390 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  41.48 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 367 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  42.66 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  39.89 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 371 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  39.51 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  43.91 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  43.91 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  37.01 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  35.88 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.49 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 984 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 983 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.27 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.18 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 383 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.77 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.72 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 423 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  27.83 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.99 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.61 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.75 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  27.41 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.56 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.84 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.07 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.33 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  22.84 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.23 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.91 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.53 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.15 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.12 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.75 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.5 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.62 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.92 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.92 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>