More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3888 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 385 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  90.24 
 
 		 398 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  50.55 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  48.66 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  50.59 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  47.35 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  50.13 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  48.92 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  48.16 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  49.36 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  43.75 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  45.68 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  49.06 
 
 		 368 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  40.33 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  45.48 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  46.05 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  41.39 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  45.76 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  43.33 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  39.35 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  42.86 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  41.82 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  42.02 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  45.92 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  43.4 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  40.71 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  40.44 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  39.11 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  39.5 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  41.94 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  36.59 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  42.01 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  40.41 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  37.77 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  39.74 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  42.34 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  38.48 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  39.34 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  36.49 
 
 		 652 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  43.24 
 
 		 342 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  36.44 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  38.6 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  38.6 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  38.6 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  37.1 
 
 		 666 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  37.31 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.31 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  36.62 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  36.81 
 
 		 666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  33.78 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.47 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  35 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  38.42 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  38.42 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.88 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.25 
 
 		 652 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 		 684 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.34 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  29.84 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.34 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  29.84 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.42 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  31.7 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.65 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.65 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  34.67 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  29.38 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.18 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  28.85 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.12 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 360 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.22 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  34.39 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.53 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  31.69 
 
 		 1033 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  31.22 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  28.2 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  28.2 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.15 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.62 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.95 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.91 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.77 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.07 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.57 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>