More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4376 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  784    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  66.39 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  66.4 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  65.63 
 
 		 378 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  49.48 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  47.57 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  45.56 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  46.33 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  46.33 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  46.33 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  46.29 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  43.3 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  46.89 
 
 		 374 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  46.37 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  42.31 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  39.51 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.35 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.29 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.55 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.84 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.53 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.53 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.18 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.53 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.69 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.24 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.88 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.66 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.08 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 983 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 984 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.8 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.11 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.11 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.11 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.34 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  23.84 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  23.84 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  23.84 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 365 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.85 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.17 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.09 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  27.06 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.72 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.72 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 389 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  26.71 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.37 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>