More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2939 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  58.2 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  57.68 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  56.6 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  56.55 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  53.85 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  52.29 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  44.97 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  47.31 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  42.05 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  47.06 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 		 383 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 		 383 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  45.7 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  45.66 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  34.58 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  33.96 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 397 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 441 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 983 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.85 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 984 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  27.25 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.74 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.05 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 960 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.11 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.41 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  27.51 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.15 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.97 
 
 		 822 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 441 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.37 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 451 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 816 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.94 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.13 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.93 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>