More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4373 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  769    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 
390 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 
386 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  57.26 
 
 
390 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
393 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  46.28 
 
 
377 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  46.09 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 
376 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
374 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
385 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
377 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
378 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
394 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.77 
 
 
384 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
376 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
384 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
383 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
391 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
383 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
383 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
389 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  36.02 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
375 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  35.01 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
378 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
389 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 
378 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.03 
 
 
394 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
382 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
442 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
984 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
983 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
383 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
382 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
382 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
395 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
960 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
381 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
389 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
389 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
389 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
496 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
500 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  28.57 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
385 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
394 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
446 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
428 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
385 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
441 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
430 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
413 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
441 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
423 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
444 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
395 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  24.69 
 
 
391 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
385 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
387 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.84 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.42 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  25.71 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  28.31 
 
 
413 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
385 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 
391 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
398 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
430 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
393 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 
385 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>