More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1501 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  92.29 
 
 		 389 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 389 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  78.49 
 
 		 389 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  56.36 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  58.92 
 
 		 391 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  56.6 
 
 		 378 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  56.91 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 		 389 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 376 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  45.83 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  43.73 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.06 
 
 		 394 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  35.86 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  32.35 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 442 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 984 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 983 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  28.47 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 960 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.21 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.89 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 816 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  26.65 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 816 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.44 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.56 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.49 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.33 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  26.34 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 799 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.56 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.39 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  23.84 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.46 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>