More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1686 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 401 aa  828    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  36.93 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  36.12 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  35.85 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  36.12 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  35.85 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  35.58 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  35.58 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  35.47 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  36.22 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.79 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  33.15 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.68 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  30.03 
 
 		 378 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.35 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.1 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.83 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.92 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.92 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.92 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.92 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.89 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.14 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.61 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.68 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  23.28 
 
 		 652 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  27.01 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  28.02 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.37 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 479 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.39 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.5 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.86 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 480 aa  102  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  26.63 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  30.77 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  26.42 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  25.51 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>