More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1839 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  53.31 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  52.21 
 
 		 378 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 378 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  51.7 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  49.14 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  48.51 
 
 		 378 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  44.88 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  41.96 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  41.08 
 
 		 365 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  38.81 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 378 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 496 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.22 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.65 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.93 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.65 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  26.67 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.65 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.65 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.32 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.93 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.76 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.76 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.93 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.94 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.65 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  26.39 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 984 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.58 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.36 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.17 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  28.17 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  26.39 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 492 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.19 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.63 
 
 		 405 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 983 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.49 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.94 
 
 		 440 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 960 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.21 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  26.59 
 
 		 684 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  32.38 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  20.6 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 496 aa  86.3  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>