More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0918 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
960 aa  1887    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 
983 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 
984 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
401 aa  190  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
488 aa  185  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4398  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.42 
 
 
473 aa  184  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  32.83 
 
 
464 aa  184  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.18 
 
 
463 aa  183  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000039  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.26 
 
 
487 aa  180  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
493 aa  178  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2520  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.82 
 
 
463 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.174199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  32.02 
 
 
463 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0790934  normal  0.848364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6550  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.18 
 
 
478 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.453687 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6066  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.05 
 
 
478 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5702  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.05 
 
 
478 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3943  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.29 
 
 
463 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  32.49 
 
 
464 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5996  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.49 
 
 
478 aa  162  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.72328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6626  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
475 aa  161  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0754  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.06 
 
 
474 aa  158  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1837  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.08 
 
 
461 aa  157  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6498  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.79 
 
 
464 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.782695  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5372  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.39 
 
 
481 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.420802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4414  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  30.61 
 
 
458 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160512  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4425  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.26 
 
 
494 aa  154  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3209  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.88 
 
 
452 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1831  opine oxidase subunit A  32.97 
 
 
455 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0254  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.26 
 
 
469 aa  152  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3537  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.32 
 
 
481 aa  151  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0414628  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
388 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0304  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  32.68 
 
 
472 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4427  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  32.85 
 
 
477 aa  150  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428597  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
376 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
389 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
389 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
385 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0747  pyridine nucleotide- disulphide oxidoreductase family protein  32.26 
 
 
477 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0885  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  30.9 
 
 
464 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
383 aa  146  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4435  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
464 aa  145  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
389 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0152  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  28.82 
 
 
469 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.789884  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3631  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
480 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.572626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4732  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.13 
 
 
480 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2712  D-nopaline dehydrogenase  33.4 
 
 
464 aa  144  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0927  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  34.08 
 
 
474 aa  142  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0689  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.39 
 
 
483 aa  141  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100515  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2940  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  31.4 
 
 
459 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.776222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
385 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6533  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  31.15 
 
 
471 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5062  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.11 
 
 
478 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278051 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8316  D-nopaline dehydrogenase  30.56 
 
 
469 aa  138  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6085  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  30.6 
 
 
468 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2708  putative opine oxidase subunit a  31.58 
 
 
472 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  31.53 
 
 
469 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.42 
 
 
377 aa  137  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
394 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4109  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.66 
 
 
501 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141512  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0780  putative FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
458 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.566332 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4934  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
460 aa  134  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
377 aa  134  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
394 aa  134  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1500  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
476 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447164  normal  0.0160451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0049  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.27 
 
 
458 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6006  oxidoreductase  33.48 
 
 
457 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195453  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7055  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.26 
 
 
476 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
395 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
467 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.84 
 
 
478 aa  127  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
378 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.9 
 
 
476 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
389 aa  127  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
374 aa  127  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
383 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1891  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  31.25 
 
 
468 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00727838  normal  0.169862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.63 
 
 
384 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
389 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
390 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1688  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  29.68 
 
 
462 aa  124  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.84 
 
 
390 aa  124  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
389 aa  124  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
394 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
373 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
393 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3515  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  30.62 
 
 
469 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646311  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
383 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
383 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.45 
 
 
488 aa  120  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
386 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
376 aa  119  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4374  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  29.33 
 
 
471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
492 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3102  hydrogen cyanide synthase HcnB  29.56 
 
 
464 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
500 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
382 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>