More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6003 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  767    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  77.63 
 
 
378 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  77.63 
 
 
378 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  74.54 
 
 
378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  66.39 
 
 
383 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  56.83 
 
 
378 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 
390 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  52.86 
 
 
376 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  49.86 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 
374 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  49.86 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  49.86 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 
385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  48.08 
 
 
378 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  50.57 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  47.85 
 
 
364 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  48.03 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 
371 aa  303  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  43.02 
 
 
365 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  42.74 
 
 
380 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  43.87 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
390 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
390 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.49 
 
 
390 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
391 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
393 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
394 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.68 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.55 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.55 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
386 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
984 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.23 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
983 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
393 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.55 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.27 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.72 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
389 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 
382 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
378 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.17 
 
 
384 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
393 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
385 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 
372 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
401 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
960 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.51 
 
 
376 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
392 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
382 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.41 
 
 
401 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
389 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
376 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
376 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.44 
 
 
375 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
388 aa  103  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
394 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 
375 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
382 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.37 
 
 
391 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 
361 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
391 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
382 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.55 
 
 
391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
389 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
389 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.55 
 
 
391 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.55 
 
 
391 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.83 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
375 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.03 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.09 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.27 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.27 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.27 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.14 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>