More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4123 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  92.18 
 
 		 371 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  68.68 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  68.41 
 
 		 375 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  68.41 
 
 		 375 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  68.41 
 
 		 375 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  69.15 
 
 		 375 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  68.6 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  69.61 
 
 		 375 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  68.32 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  68.03 
 
 		 368 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  68.04 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  68.32 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  68.04 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  67.03 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  67.03 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  66.67 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  55.38 
 
 		 375 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  53.04 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  52.46 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 398 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  35.65 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.58 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.76 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.01 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  26.54 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.45 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.24 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.24 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.24 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.52 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.24 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.24 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.24 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.51 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.65 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.38 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.6 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23.55 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 441 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 960 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.79 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.34 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.36 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.77 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  24.88 
 
 		 460 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.63 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.21 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.64 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.95 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 984 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.08 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.32 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.39 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 437 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.86 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>