More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7056 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
393 aa  791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  81.03 
 
 
390 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  82.4 
 
 
390 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  78.61 
 
 
386 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
385 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 
388 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
376 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  44.24 
 
 
377 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
374 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
389 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
389 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
385 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
378 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
383 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
383 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 
383 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
389 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 
377 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  37.3 
 
 
384 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
391 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
394 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
394 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
384 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  38.57 
 
 
375 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
389 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
375 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 
382 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
376 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
378 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  34.04 
 
 
380 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.6 
 
 
394 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
383 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
389 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
984 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
983 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
383 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
382 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
396 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
444 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
401 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
383 aa  123  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
385 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
960 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
387 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
442 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.78 
 
 
442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
442 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.78 
 
 
442 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
444 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
442 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.78 
 
 
442 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.78 
 
 
442 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
455 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.78 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.04 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
395 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
428 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
385 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
500 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
492 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
373 aa  113  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
374 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
374 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
394 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
398 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
415 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
394 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.9 
 
 
391 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
433 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.31 
 
 
423 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
442 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
430 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
399 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
381 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
819 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
392 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  21.43 
 
 
391 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
430 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
385 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
385 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>