More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1730 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 382 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 		 382 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  54.19 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 496 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 500 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.6 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 816 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 816 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  33.85 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  33.33 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 799 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.61 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 823 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.31 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  30.31 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 819 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  32.28 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.05 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.57 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  30.71 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  28.94 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 817 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.87 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.23 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.77 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  31.77 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 825 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.69 
 
 		 417 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  30.55 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  30.55 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.97 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.09 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.23 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.94 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  29.21 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.52 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 827 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 831 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.78 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.27 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.54 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 806 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  28.1 
 
 		 831 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.46 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.97 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  29.08 
 
 		 416 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 805 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 815 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.09 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 843 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.73 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>