More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5994 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
374 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  87.7 
 
 
374 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  86.36 
 
 
374 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  86.36 
 
 
374 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  51.38 
 
 
385 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 
378 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  52.41 
 
 
378 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 
378 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  47.81 
 
 
383 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 
376 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  48.53 
 
 
378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  48.49 
 
 
371 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 
372 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  47.04 
 
 
385 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  45.23 
 
 
378 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  44.35 
 
 
375 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  45.86 
 
 
367 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  41.71 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  44.73 
 
 
356 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  40.57 
 
 
365 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 
369 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  39.73 
 
 
380 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  44.35 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
390 aa  122  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
386 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
393 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.21 
 
 
382 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
390 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
378 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.86 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.77 
 
 
417 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.4 
 
 
390 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
393 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
383 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
383 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.9 
 
 
378 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 
371 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.89 
 
 
372 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
983 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.38 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
376 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
375 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
401 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
394 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.46 
 
 
389 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.91 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.6 
 
 
369 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.53 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.94 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.53 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
984 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.94 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.03 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.84 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.94 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.99 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.25 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
960 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
383 aa  95.9  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
382 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.21 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.31 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.84 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.32 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  27.49 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.53 
 
 
410 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 
375 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.44 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  30.61 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
500 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
375 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
389 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
500 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
389 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.25 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.84 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.25 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
380 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.62 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>