More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1933 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 369 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  48.03 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  45.5 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  48.28 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 		 378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 		 378 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  45.87 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  45.69 
 
 		 378 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  46.37 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 		 385 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 		 390 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 371 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  44.72 
 
 		 378 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  40.86 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  41.43 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  40.05 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  40.9 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 984 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 983 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  21.54 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  21.49 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  21.49 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  21.49 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  21.54 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  21.54 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  22.04 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  21.22 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.96 
 
 		 384 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.83 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.83 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.37 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.1 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.5 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.16 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.06 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.24 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  21.91 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.16 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  24.73 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.28 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 960 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  26.47 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.89 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  25.2 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.98 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.13 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>