More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0884 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 377 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  81.3 
 
 		 376 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  80.22 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  70.88 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  62.23 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  63.74 
 
 		 394 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  65.38 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  55.65 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  55.65 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  56.79 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 		 378 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  54.18 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  56.44 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  44.97 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  54.09 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  45.36 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  45.17 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  36.29 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  35.97 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 960 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 983 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 984 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  29.88 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 823 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  28.03 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  28.43 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 496 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 444 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 500 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 492 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.92 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.92 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>