More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3583 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  752    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  32.43 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 984 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 983 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.04 
 
 		 388 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  27.4 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  29.27 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.08 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 960 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.62 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.97 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.14 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.86 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  26.27 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  25.54 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 816 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  24.86 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 816 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.47 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.13 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.47 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.8 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.47 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 806 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.47 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.7 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 819 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.09 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.64 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  24.47 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 799 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  25.91 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.09 
 
 		 838 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  25.94 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  24.05 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  24.05 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>