More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4955 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 442 aa  880    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  51.02 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  48.94 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  46.47 
 
 		 442 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 441 aa  355  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  44.7 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  44.93 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  45.77 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  44.93 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  44.93 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 441 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  41.51 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  45.12 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  42.82 
 
 		 443 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  40.71 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  34.78 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.41 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 442 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 389 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  29.56 
 
 		 377 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.8 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 394 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5602  AgaE protein, conversion of agropinic acid to mannopinic acid  39.02 
 
 		 134 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592638  hitchhiker  0.00552874 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.37 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 397 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>