More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7399 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  26.86 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.66 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 960 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.61 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.23 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.08 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.94 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  26.48 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 984 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.23 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  24.68 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.1 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 983 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.92 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  21.03 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  21.76 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 835 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.67 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  21.95 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 815 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.67 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.67 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  25.71 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  28.7 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  28.7 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.87 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.06 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  23.78 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  24.03 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.61 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 835 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.61 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  23.72 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  22.75 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.34 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  24.15 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.64 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  21.89 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  22.77 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>