More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0284 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  760    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.3 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 496 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 816 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 816 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 815 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 823 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 806 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 819 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 799 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 805 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  25.24 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 825 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  29.69 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 826 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 806 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 817 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.94 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 812 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  26.77 
 
 		 447 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 815 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  29.5 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 797 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 812 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.35 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 815 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  28.28 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 843 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  28.64 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.89 
 
 		 838 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.79 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 801 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.06 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 444 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.8 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  26.1 
 
 		 442 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>