More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1481 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 801 aa  1655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 804 aa  691    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 806 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  45.42 
 
 		 805 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 		 797 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 802 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 806 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 806 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  34.36 
 
 		 879 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 816 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 815 aa  439  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 837 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 835 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 816 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 816 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  30.86 
 
 		 831 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 821 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 831 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 799 aa  366  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 825 aa  363  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 843 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  31.03 
 
 		 831 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  31.15 
 
 		 831 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 819 aa  353  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 830 aa  349  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 815 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 815 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  31.49 
 
 		 822 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 823 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 831 aa  341  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 826 aa  337  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  29.79 
 
 		 831 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 812 aa  334  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 817 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 827 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 815 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 812 aa  290  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.97 
 
 		 850 aa  283  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  26.84 
 
 		 854 aa  278  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.8 
 
 		 857 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 830 aa  268  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 830 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 830 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 835 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.16 
 
 		 819 aa  260  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 835 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  28.59 
 
 		 816 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.41 
 
 		 821 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.54 
 
 		 830 aa  247  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.86 
 
 		 838 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  26.86 
 
 		 808 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.38 
 
 		 840 aa  205  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  24.4 
 
 		 948 aa  203  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 853 aa  197  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 853 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 853 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 853 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.62 
 
 		 386 aa  161  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 390 aa  159  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.16 
 
 		 364 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.73 
 
 		 364 aa  149  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 388 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 385 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 385 aa  147  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 385 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 		 366 aa  144  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 366 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 373 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 395 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  29.18 
 
 		 367 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 496 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 381 aa  132  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  31.71 
 
 		 364 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 383 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 500 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 500 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 382 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 382 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28 
 
 		 360 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.27 
 
 		 360 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.83 
 
 		 369 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.73 
 
 		 360 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  29.66 
 
 		 442 aa  125  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  29.66 
 
 		 440 aa  125  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.33 
 
 		 963 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 378 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  25.45 
 
 		 364 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>