More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0798 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 822 aa  1637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 816 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 825 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 843 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 815 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 		 812 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 823 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 817 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  39.34 
 
 		 831 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 831 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 815 aa  535  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 827 aa  522  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 		 826 aa  519  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 799 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 835 aa  475  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 815 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.18 
 
 		 821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.02 
 
 		 819 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 819 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.92 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 830 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 802 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 830 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 830 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 806 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.88 
 
 		 850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 806 aa  446  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  34.03 
 
 		 879 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  35.46 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.37 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 827 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  33.69 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 815 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 831 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 816 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.6 
 
 		 838 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 835 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 837 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  32.62 
 
 		 831 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 804 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  33.45 
 
 		 831 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 821 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 830 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  31.25 
 
 		 948 aa  360  7e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  31.68 
 
 		 854 aa  355  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  34.1 
 
 		 840 aa  349  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 797 aa  340  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 801 aa  329  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 853 aa  267  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 853 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 853 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  32.77 
 
 		 977 aa  181  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.34 
 
 		 360 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.06 
 
 		 386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.12 
 
 		 366 aa  164  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.12 
 
 		 366 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  161  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  161  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  161  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  161  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.75 
 
 		 366 aa  161  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 366 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.93 
 
 		 368 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 496 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.25 
 
 		 364 aa  158  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.85 
 
 		 364 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.14 
 
 		 364 aa  157  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.88 
 
 		 365 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 364 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.19 
 
 		 375 aa  154  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.4 
 
 		 381 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.88 
 
 		 988 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 382 aa  149  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.41 
 
 		 360 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.08 
 
 		 371 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.07 
 
 		 365 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28.46 
 
 		 357 aa  147  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  28.18 
 
 		 360 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  30.66 
 
 		 360 aa  145  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 385 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  34.82 
 
 		 372 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.34 
 
 		 370 aa  144  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.43 
 
 		 360 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  31.75 
 
 		 367 aa  144  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.54 
 
 		 1002 aa  144  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 376 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.07 
 
 		 987 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 385 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>