More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2459 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  48.19 
 
 		 948 aa  740    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  56.52 
 
 		 808 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.64 
 
 		 830 aa  923    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  60.22 
 
 		 819 aa  973    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  62.5 
 
 		 821 aa  991    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  96.39 
 
 		 830 aa  1599    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  78.77 
 
 		 816 aa  1288    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 830 aa  1684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  54.93 
 
 		 812 aa  855    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  54.22 
 
 		 835 aa  877    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  55.3 
 
 		 835 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 830 aa  1684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.76 
 
 		 857 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.86 
 
 		 850 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.47 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  38.3 
 
 		 840 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  37.71 
 
 		 822 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 843 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.37 
 
 		 815 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 815 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 		 817 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 816 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 825 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  32.98 
 
 		 831 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 815 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 819 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 831 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 827 aa  343  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 806 aa  335  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 826 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 853 aa  331  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 853 aa  324  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 853 aa  320  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 853 aa  320  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 802 aa  320  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  27.73 
 
 		 879 aa  307  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 827 aa  304  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  29.99 
 
 		 835 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 805 aa  300  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 831 aa  298  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  29.6 
 
 		 831 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 837 aa  296  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 804 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 816 aa  287  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 815 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  28.9 
 
 		 831 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  28.48 
 
 		 831 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 797 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  27.82 
 
 		 854 aa  262  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 821 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 801 aa  258  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.42 
 
 		 371 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 393 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.99 
 
 		 364 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.29 
 
 		 364 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.03 
 
 		 364 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.96 
 
 		 364 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  32.24 
 
 		 965 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.11 
 
 		 988 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.44 
 
 		 363 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  31.85 
 
 		 361 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.44 
 
 		 363 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.7 
 
 		 360 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.41 
 
 		 375 aa  153  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.41 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.16 
 
 		 360 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 366 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.16 
 
 		 360 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.93 
 
 		 360 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 366 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 366 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 366 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 366 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.41 
 
 		 365 aa  151  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.14 
 
 		 967 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  27.52 
 
 		 357 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  29.8 
 
 		 977 aa  150  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.81 
 
 		 998 aa  150  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.44 
 
 		 368 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07324  N,N-dimethylglycine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_2G16610)  32.7 
 
 		 393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.33 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  31.25 
 
 		 440 aa  149  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  31.25 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  32.09 
 
 		 1000 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 		 430 aa  147  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  35.29 
 
 		 757 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  29.69 
 
 		 360 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.81 
 
 		 987 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 366 aa  147  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 366 aa  147  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 366 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 		 370 aa  147  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.37 
 
 		 999 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>