More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5916 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.01 
 
 		 968 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.4 
 
 		 963 aa  1002    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  45.78 
 
 		 968 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  50.21 
 
 		 961 aa  935    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  47.66 
 
 		 965 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  52.48 
 
 		 961 aa  959    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.54 
 
 		 967 aa  815    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 988 aa  2023    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  52.71 
 
 		 977 aa  993    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  37.34 
 
 		 1000 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.54 
 
 		 999 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  35.4 
 
 		 1000 aa  555  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.43 
 
 		 1007 aa  542  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.43 
 
 		 1007 aa  542  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  37.11 
 
 		 1003 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.51 
 
 		 1002 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.6 
 
 		 1019 aa  539  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.84 
 
 		 997 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.15 
 
 		 1000 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.72 
 
 		 1004 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.82 
 
 		 1004 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.92 
 
 		 1004 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  37.12 
 
 		 1003 aa  529  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  36.18 
 
 		 1028 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.32 
 
 		 985 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.85 
 
 		 1005 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.11 
 
 		 1003 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.39 
 
 		 984 aa  529  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.14 
 
 		 1005 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.78 
 
 		 997 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35.76 
 
 		 1005 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.06 
 
 		 1003 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.21 
 
 		 1002 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.15 
 
 		 1003 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.97 
 
 		 1003 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  36.72 
 
 		 1005 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.15 
 
 		 1003 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.51 
 
 		 1003 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  38.23 
 
 		 998 aa  521  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  36.17 
 
 		 1006 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.65 
 
 		 993 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  37.11 
 
 		 1002 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.21 
 
 		 1002 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  34.26 
 
 		 993 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  36.9 
 
 		 1003 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  36.43 
 
 		 1005 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.88 
 
 		 999 aa  515  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.06 
 
 		 1006 aa  515  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.49 
 
 		 993 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.48 
 
 		 1010 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.81 
 
 		 995 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.74 
 
 		 995 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.23 
 
 		 995 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.79 
 
 		 999 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.85 
 
 		 997 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.5 
 
 		 995 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  34.73 
 
 		 997 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.2 
 
 		 997 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.63 
 
 		 984 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.27 
 
 		 999 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.83 
 
 		 1005 aa  496  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.93 
 
 		 995 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.61 
 
 		 987 aa  492  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.03 
 
 		 1008 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.82 
 
 		 1011 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.04 
 
 		 1009 aa  489  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.69 
 
 		 1003 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.35 
 
 		 1009 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  34.96 
 
 		 987 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.24 
 
 		 976 aa  482  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.57 
 
 		 992 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.12 
 
 		 977 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.81 
 
 		 1009 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.68 
 
 		 974 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  37.03 
 
 		 889 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.16 
 
 		 981 aa  462  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.7 
 
 		 976 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.59 
 
 		 987 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.36 
 
 		 989 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.67 
 
 		 984 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  34.59 
 
 		 980 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.61 
 
 		 984 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.18 
 
 		 955 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.2 
 
 		 984 aa  396  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  35.73 
 
 		 937 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  32.77 
 
 		 925 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.85 
 
 		 980 aa  365  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.95 
 
 		 767 aa  349  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  38.05 
 
 		 909 aa  269  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  33.16 
 
 		 357 aa  191  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  30.71 
 
 		 442 aa  181  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  31.3 
 
 		 440 aa  179  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.27 
 
 		 857 aa  179  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.54 
 
 		 364 aa  179  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.88 
 
 		 370 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.72 
 
 		 368 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.19 
 
 		 364 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.48 
 
 		 364 aa  174  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.45 
 
 		 360 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  32.4 
 
 		 371 aa  171  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>