More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0943 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.41 
 
 		 999 aa  826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.45 
 
 		 987 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.04 
 
 		 1004 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.2 
 
 		 1003 aa  835    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  46.25 
 
 		 1003 aa  820    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.92 
 
 		 1002 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  45.61 
 
 		 1028 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  43.5 
 
 		 980 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.39 
 
 		 1007 aa  718    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.39 
 
 		 1007 aa  718    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.77 
 
 		 999 aa  753    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.9 
 
 		 985 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  42.81 
 
 		 1006 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  44.66 
 
 		 1005 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  45.4 
 
 		 889 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  42.81 
 
 		 1006 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.74 
 
 		 997 aa  709    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.36 
 
 		 992 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.31 
 
 		 1003 aa  830    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  42.67 
 
 		 1000 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.98 
 
 		 989 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.83 
 
 		 1002 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  42.79 
 
 		 1005 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  48 
 
 		 993 aa  815    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  47.1 
 
 		 1003 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.26 
 
 		 1000 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  43.34 
 
 		 997 aa  727    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.88 
 
 		 1010 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.81 
 
 		 1009 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  47.55 
 
 		 1002 aa  836    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.49 
 
 		 984 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.53 
 
 		 995 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.89 
 
 		 987 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.93 
 
 		 1009 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.62 
 
 		 1009 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.75 
 
 		 1003 aa  766    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.45 
 
 		 999 aa  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.11 
 
 		 976 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.14 
 
 		 1004 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  45.92 
 
 		 1000 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.01 
 
 		 1019 aa  691    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.12 
 
 		 984 aa  680    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.8 
 
 		 984 aa  748    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.61 
 
 		 995 aa  755    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.76 
 
 		 1011 aa  743    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.18 
 
 		 981 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.95 
 
 		 1003 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.9 
 
 		 1003 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.24 
 
 		 1004 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.61 
 
 		 995 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.94 
 
 		 997 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.98 
 
 		 999 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 974 aa  1945    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  42.01 
 
 		 987 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.05 
 
 		 997 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.29 
 
 		 993 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.4 
 
 		 1003 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  44.86 
 
 		 1005 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.92 
 
 		 1002 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.95 
 
 		 1003 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.99 
 
 		 998 aa  752    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.59 
 
 		 997 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.42 
 
 		 977 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.14 
 
 		 1005 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.58 
 
 		 1008 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.67 
 
 		 976 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.31 
 
 		 995 aa  766    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.9 
 
 		 995 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.5 
 
 		 1005 aa  721    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.1 
 
 		 1003 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.22 
 
 		 1005 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.24 
 
 		 993 aa  819    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.7 
 
 		 984 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  42.04 
 
 		 925 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.02 
 
 		 984 aa  585  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  43.3 
 
 		 937 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  37.1 
 
 		 968 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.09 
 
 		 968 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  37.75 
 
 		 965 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.76 
 
 		 967 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  39.16 
 
 		 980 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.1 
 
 		 955 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.73 
 
 		 963 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  34.39 
 
 		 977 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.76 
 
 		 767 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  35.34 
 
 		 961 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.44 
 
 		 961 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.91 
 
 		 988 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  48.98 
 
 		 909 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.28 
 
 		 364 aa  183  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.54 
 
 		 364 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  34.81 
 
 		 381 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  34.38 
 
 		 369 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.77 
 
 		 372 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  35.98 
 
 		 372 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.01 
 
 		 441 aa  162  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  30.13 
 
 		 357 aa  160  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.86 
 
 		 362 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.59 
 
 		 377 aa  158  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  33.77 
 
 		 381 aa  157  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>