More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6206 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  81.69 
 
 		 1004 aa  1681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  81.61 
 
 		 1005 aa  1681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.36 
 
 		 997 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.73 
 
 		 995 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  57.1 
 
 		 1003 aa  1083    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  56.48 
 
 		 1028 aa  1094    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.22 
 
 		 984 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.85 
 
 		 993 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  64.19 
 
 		 1007 aa  1353    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  64.19 
 
 		 1007 aa  1353    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  50.79 
 
 		 999 aa  951    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.26 
 
 		 997 aa  845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  81.31 
 
 		 1006 aa  1687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.81 
 
 		 1009 aa  742    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43 
 
 		 984 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.6 
 
 		 1009 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  57.29 
 
 		 889 aa  956    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  81.31 
 
 		 1006 aa  1689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.35 
 
 		 987 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  45.37 
 
 		 925 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.18 
 
 		 984 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  58.02 
 
 		 1003 aa  1120    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  50.15 
 
 		 1000 aa  959    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  81.49 
 
 		 1005 aa  1694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  57.11 
 
 		 1002 aa  1087    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  81.29 
 
 		 1005 aa  1689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  45.75 
 
 		 993 aa  837    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  57.47 
 
 		 1003 aa  1099    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  56.29 
 
 		 1000 aa  1067    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.95 
 
 		 993 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.84 
 
 		 1003 aa  1103    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.97 
 
 		 1005 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  57.67 
 
 		 1002 aa  1101    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.59 
 
 		 995 aa  893    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  47.67 
 
 		 997 aa  866    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.49 
 
 		 1008 aa  743    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.29 
 
 		 987 aa  725    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.52 
 
 		 1009 aa  766    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.66 
 
 		 974 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.4 
 
 		 999 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.77 
 
 		 976 aa  680    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  56.19 
 
 		 1000 aa  1099    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  100 
 
 		 1005 aa  2069    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.02 
 
 		 995 aa  931    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  68.57 
 
 		 1019 aa  1401    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.8 
 
 		 999 aa  919    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.09 
 
 		 984 aa  772    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  81.49 
 
 		 1004 aa  1682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.42 
 
 		 1011 aa  797    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.02 
 
 		 1003 aa  912    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.69 
 
 		 981 aa  703    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.84 
 
 		 1003 aa  1105    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.93 
 
 		 995 aa  929    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.36 
 
 		 999 aa  1104    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.62 
 
 		 767 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.67 
 
 		 985 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.7 
 
 		 997 aa  896    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.54 
 
 		 980 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.24 
 
 		 992 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  58.33 
 
 		 1003 aa  1110    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  58.06 
 
 		 1003 aa  1108    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  68.79 
 
 		 1010 aa  1407    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  57.11 
 
 		 1002 aa  1085    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  99 
 
 		 1005 aa  2052    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.65 
 
 		 984 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  41.72 
 
 		 980 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.84 
 
 		 1003 aa  1105    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  57.21 
 
 		 1002 aa  1088    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.76 
 
 		 977 aa  765    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.46 
 
 		 997 aa  872    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.9 
 
 		 976 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.34 
 
 		 995 aa  892    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  43.98 
 
 		 987 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.33 
 
 		 989 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.84 
 
 		 998 aa  872    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  81.69 
 
 		 1004 aa  1682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  58.25 
 
 		 1003 aa  1112    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  46.29 
 
 		 937 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.1 
 
 		 955 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.75 
 
 		 968 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  38.3 
 
 		 965 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  37.08 
 
 		 968 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.36 
 
 		 967 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.29 
 
 		 963 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  35.69 
 
 		 977 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  34.84 
 
 		 961 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.43 
 
 		 988 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  54.21 
 
 		 909 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  34.64 
 
 		 961 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  30.51 
 
 		 357 aa  164  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 825 aa  155  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.63 
 
 		 370 aa  155  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.32 
 
 		 857 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.23 
 
 		 364 aa  153  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.5 
 
 		 364 aa  153  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 812 aa  149  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 799 aa  149  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.69 
 
 		 364 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.16 
 
 		 371 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 843 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>