More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4871 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  67.91 
 
 		 831 aa  1129    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  52.75 
 
 		 816 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  61.27 
 
 		 823 aa  1011    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 815 aa  794    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  68.56 
 
 		 827 aa  1103    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  49.39 
 
 		 812 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  68.47 
 
 		 831 aa  1135    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  54.06 
 
 		 843 aa  843    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 819 aa  759    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 		 816 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 825 aa  1684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 		 817 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 		 815 aa  819    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  45.38 
 
 		 815 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  58.01 
 
 		 826 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 827 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 799 aa  621  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  40.67 
 
 		 822 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  39.52 
 
 		 854 aa  561  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  35.83 
 
 		 879 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 806 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 806 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 816 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 806 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 815 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 805 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 812 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 804 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 831 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  34.58 
 
 		 831 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 837 aa  435  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 835 aa  432  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 821 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  33.86 
 
 		 831 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.77 
 
 		 850 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.1 
 
 		 857 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 830 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.85 
 
 		 821 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  33.29 
 
 		 831 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 830 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 830 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  32.56 
 
 		 808 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 835 aa  389  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 835 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 830 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.33 
 
 		 819 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 816 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.12 
 
 		 830 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 801 aa  359  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.46 
 
 		 838 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.26 
 
 		 840 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  30.03 
 
 		 948 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 853 aa  254  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 853 aa  237  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 853 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 853 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 385 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 385 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.9 
 
 		 386 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 385 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 383 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 390 aa  172  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.08 
 
 		 987 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.46 
 
 		 364 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.97 
 
 		 1003 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.45 
 
 		 995 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.88 
 
 		 999 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.12 
 
 		 999 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  36.05 
 
 		 364 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 382 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  29.88 
 
 		 909 aa  164  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  31.18 
 
 		 371 aa  164  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.71 
 
 		 995 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.2 
 
 		 997 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  31.55 
 
 		 357 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.25 
 
 		 998 aa  162  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  29.17 
 
 		 1000 aa  162  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.88 
 
 		 997 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 500 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.05 
 
 		 362 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.53 
 
 		 364 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.96 
 
 		 995 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 500 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.68 
 
 		 368 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.71 
 
 		 995 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.56 
 
 		 995 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.6 
 
 		 997 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.88 
 
 		 997 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  32.96 
 
 		 371 aa  157  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 496 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.29 
 
 		 984 aa  157  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.45 
 
 		 366 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>