More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2488 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 806 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 801 aa  690    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 806 aa  1660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 802 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  75 
 
 		 804 aa  1234    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  77.13 
 
 		 805 aa  1312    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  46.13 
 
 		 806 aa  691    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  45.8 
 
 		 797 aa  675    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 816 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  37.28 
 
 		 879 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 815 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 816 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 816 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 815 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 825 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 837 aa  475  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 835 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 843 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  34.86 
 
 		 831 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 831 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 812 aa  452  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  35.45 
 
 		 831 aa  452  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 831 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  35.56 
 
 		 831 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 827 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 815 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 830 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 817 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  35.01 
 
 		 831 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 821 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 819 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  33.97 
 
 		 822 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 827 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 815 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 826 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 799 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  30.73 
 
 		 854 aa  358  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.14 
 
 		 821 aa  347  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.41 
 
 		 819 aa  337  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 830 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 830 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 830 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 816 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 835 aa  316  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.05 
 
 		 830 aa  314  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 835 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  29.3 
 
 		 808 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.98 
 
 		 850 aa  302  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.36 
 
 		 838 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 		 857 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.2 
 
 		 840 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  26.1 
 
 		 948 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 853 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 853 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 853 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.83 
 
 		 386 aa  172  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  27.75 
 
 		 365 aa  167  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 390 aa  163  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  30.93 
 
 		 440 aa  158  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  30.93 
 
 		 442 aa  158  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 388 aa  155  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 385 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 385 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.87 
 
 		 362 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  27.32 
 
 		 365 aa  151  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 		 364 aa  147  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 385 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.53 
 
 		 1019 aa  145  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 381 aa  145  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.94 
 
 		 364 aa  144  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 		 366 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.43 
 
 		 925 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.39 
 
 		 357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  27.76 
 
 		 366 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 395 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 382 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 366 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.4 
 
 		 371 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 382 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  26.53 
 
 		 364 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  29.82 
 
 		 366 aa  138  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  26.55 
 
 		 360 aa  138  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.83 
 
 		 380 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  27.6 
 
 		 364 aa  137  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.68 
 
 		 767 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.52 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.95 
 
 		 1003 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.63 
 
 		 366 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>