More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2461 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
380 aa  780    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  49.19 
 
 
366 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  47.98 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  47.01 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.24 
 
 
368 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  44.89 
 
 
370 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  47.06 
 
 
366 aa  332  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.9 
 
 
364 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 
364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  45.41 
 
 
371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.09 
 
 
366 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.09 
 
 
366 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.09 
 
 
366 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.09 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.17 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.08 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.47 
 
 
364 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.01 
 
 
366 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.14 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  44.54 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.66 
 
 
360 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.93 
 
 
360 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.66 
 
 
360 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.82 
 
 
366 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  43.13 
 
 
357 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  44.81 
 
 
361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.5 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  42.78 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.67 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  44.14 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  43.13 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  42.01 
 
 
367 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  41.65 
 
 
389 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 
441 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  42.22 
 
 
375 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.28 
 
 
362 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
362 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  41.6 
 
 
369 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  44.14 
 
 
351 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  43.09 
 
 
364 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.89 
 
 
369 aa  285  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  43.55 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.8 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.51 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 
363 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.48 
 
 
365 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  44.51 
 
 
350 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.24 
 
 
372 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  43.62 
 
 
375 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  40.1 
 
 
381 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 
364 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.49 
 
 
365 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 
364 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 
364 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.08 
 
 
366 aa  275  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.41 
 
 
370 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.98 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 
363 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.32 
 
 
376 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
430 aa  268  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  39.73 
 
 
357 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
365 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
372 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 
362 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  40.27 
 
 
363 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.02 
 
 
381 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  39.13 
 
 
365 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  40.86 
 
 
372 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.38 
 
 
365 aa  256  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  39.45 
 
 
356 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.22 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
372 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
360 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.34 
 
 
365 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
368 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
360 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.7 
 
 
372 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.13 
 
 
375 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  38.86 
 
 
391 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.55 
 
 
374 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.56 
 
 
378 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.32 
 
 
369 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  37.67 
 
 
386 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.7 
 
 
370 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  36.39 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  37.27 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 
371 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>