More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2054 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
374 aa  760    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  82.35 
 
 
365 aa  627  1e-179  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.29 
 
 
363 aa  448  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.28 
 
 
390 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  54.26 
 
 
366 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.8 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  41.11 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  40.58 
 
 
357 aa  282  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  41.13 
 
 
371 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.36 
 
 
363 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.36 
 
 
363 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.59 
 
 
360 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.59 
 
 
360 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 
360 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 
366 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.05 
 
 
366 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  39.1 
 
 
365 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.36 
 
 
359 aa  272  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  272  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.01 
 
 
364 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 
370 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.23 
 
 
360 aa  268  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
366 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.9 
 
 
368 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  38.95 
 
 
371 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.2 
 
 
360 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 
364 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.86 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.37 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  37.3 
 
 
367 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 
362 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.84 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.26 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  43.7 
 
 
372 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.58 
 
 
364 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  39.63 
 
 
371 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.41 
 
 
376 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 
363 aa  256  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.28 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  38.98 
 
 
375 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.41 
 
 
362 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 
365 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  40.26 
 
 
375 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  41.51 
 
 
367 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  36.87 
 
 
365 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.75 
 
 
369 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.75 
 
 
369 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.8 
 
 
374 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  37.63 
 
 
361 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.53 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.73 
 
 
375 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.34 
 
 
372 aa  245  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.27 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.39 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.1 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  38.17 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.62 
 
 
362 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  40.85 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.64 
 
 
363 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.11 
 
 
403 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.3 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.74 
 
 
365 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.36 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.12 
 
 
365 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  40.82 
 
 
363 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.05 
 
 
377 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 
351 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  39.18 
 
 
379 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  40.15 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.09 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.21 
 
 
385 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  36.46 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.04 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.07 
 
 
381 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 
364 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.68 
 
 
382 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  37.47 
 
 
369 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.68 
 
 
362 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.87 
 
 
364 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 
363 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.05 
 
 
360 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.26 
 
 
365 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  37.1 
 
 
361 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  37.27 
 
 
350 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.98 
 
 
370 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.25 
 
 
370 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.63 
 
 
370 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2576  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.37 
 
 
364 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213671  normal  0.0237764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  37.3 
 
 
363 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  39.11 
 
 
381 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 
360 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>