More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2005 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 350 aa  717    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  73.35 
 
 		 351 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  58.79 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.31 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.65 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.75 
 
 		 364 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  47.92 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.75 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.41 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.39 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.43 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  48.1 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.41 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.63 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  47.35 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.13 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  48.46 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  44.85 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.43 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  45.48 
 
 		 361 aa  291  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  44.44 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  45.53 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.58 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.58 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.54 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.58 
 
 		 366 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  44.97 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  46.02 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.02 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.3 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  46.22 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  46.89 
 
 		 369 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.04 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.03 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  46.37 
 
 		 375 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.19 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.02 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  46.65 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.85 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.51 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.07 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.48 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.18 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  43.3 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.49 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.99 
 
 		 369 aa  279  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  45.56 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.63 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45 
 
 		 381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  45.18 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.17 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  48.86 
 
 		 372 aa  272  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  47.21 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  42.69 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  43.94 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  44.82 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.13 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.62 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.93 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.06 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.06 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  43.54 
 
 		 378 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.61 
 
 		 363 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 		 369 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 		 369 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  40.56 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  44.85 
 
 		 391 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 		 365 aa  258  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.51 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  44.04 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.54 
 
 		 372 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.37 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  43.42 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  40.32 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  44.2 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.34 
 
 		 368 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  41.71 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  43.38 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.25 
 
 		 375 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.54 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3325  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  43.24 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.78 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.48 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  40.93 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  42.44 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994.1  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1542  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0146  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>