More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0720 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 364 aa  755    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  57.81 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.06 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  58.52 
 
 		 366 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.22 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  52.75 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.63 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.65 
 
 		 366 aa  391  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.37 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.37 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.37 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  50.84 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.27 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  51.66 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  48.08 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.3 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  51.37 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  51.11 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  50.69 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.39 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.91 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.6 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  50.7 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.32 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.86 
 
 		 360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.77 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.37 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.86 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  50.41 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  49.59 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  48.61 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.7 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  46.65 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.83 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.69 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.92 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  47.09 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  46.01 
 
 		 389 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.93 
 
 		 364 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.57 
 
 		 380 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.6 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.4 
 
 		 363 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.01 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.4 
 
 		 363 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  46.3 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  45.38 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.14 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  47.24 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.44 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.78 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.31 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  45.43 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  43.41 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.39 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  47.35 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.83 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  41.19 
 
 		 378 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.5 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  40.22 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  42.12 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  41.11 
 
 		 374 aa  282  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.29 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  41.74 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.88 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3311  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.574966  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.44 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  42.5 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  41.62 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.38 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  39.61 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  45.3 
 
 		 374 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  40.93 
 
 		 371 aa  271  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0622  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.59 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>