More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0765 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
385 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  80.52 
 
 
382 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  79.48 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  56.6 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.82 
 
 
370 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  57.4 
 
 
379 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  55.58 
 
 
401 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.17 
 
 
362 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.1 
 
 
365 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  57.89 
 
 
364 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  55.53 
 
 
391 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  54.9 
 
 
369 aa  362  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  52.16 
 
 
388 aa  362  9e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.4 
 
 
377 aa  359  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  55.38 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.54 
 
 
372 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  51.3 
 
 
386 aa  328  9e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  48.97 
 
 
381 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  46.13 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.34 
 
 
366 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  42.22 
 
 
363 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
366 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  44.59 
 
 
371 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.6 
 
 
366 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.6 
 
 
366 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.6 
 
 
366 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.6 
 
 
366 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.6 
 
 
366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.34 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.34 
 
 
366 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  44.06 
 
 
370 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  41.04 
 
 
365 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.78 
 
 
367 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  42.34 
 
 
360 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.47 
 
 
364 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  42.33 
 
 
361 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.11 
 
 
376 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.16 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  40.53 
 
 
367 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.53 
 
 
364 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  40.21 
 
 
366 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
364 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.15 
 
 
441 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.69 
 
 
381 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.11 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 
378 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.97 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
360 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  39.02 
 
 
366 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 
351 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  41.52 
 
 
389 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.42 
 
 
360 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
360 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.84 
 
 
364 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  37.04 
 
 
365 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.17 
 
 
363 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.17 
 
 
363 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  42.67 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  38.34 
 
 
357 aa  245  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.16 
 
 
360 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.7 
 
 
372 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  42.37 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.64 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.43 
 
 
372 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  41.73 
 
 
369 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.89 
 
 
365 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.2 
 
 
363 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  39.21 
 
 
374 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.48 
 
 
363 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 
369 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  38.93 
 
 
365 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 
369 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.95 
 
 
374 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.99 
 
 
366 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.73 
 
 
369 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.86 
 
 
360 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.92 
 
 
372 aa  236  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.74 
 
 
363 aa  236  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.76 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.12 
 
 
380 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.06 
 
 
362 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.26 
 
 
372 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  40.1 
 
 
398 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.36 
 
 
381 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 
369 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.26 
 
 
363 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.68 
 
 
403 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  36.98 
 
 
364 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 
370 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3211  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.62 
 
 
364 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00211141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.17 
 
 
430 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  37.69 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.58 
 
 
363 aa  226  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 
364 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.22 
 
 
365 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>