More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3299 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 389 aa  784    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.27 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.27 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.27 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.8 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  49.2 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  45.72 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  48.94 
 
 		 371 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  47.52 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  45.74 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  46.54 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  46.01 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.44 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.32 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.32 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.32 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  48.16 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.53 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.95 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  44.65 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.79 
 
 		 366 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.24 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  42.74 
 
 		 365 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.12 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  43.77 
 
 		 366 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.26 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.77 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.95 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.27 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  45.41 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.22 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.22 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.47 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.88 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.35 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.18 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 		 363 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.12 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.34 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  44.27 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.56 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.65 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  45.36 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  44.18 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  43.12 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  42.33 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.49 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  44.99 
 
 		 369 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.56 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.95 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.49 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.73 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  47.41 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.97 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.49 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.03 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  44.71 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.97 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.03 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.53 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.53 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.13 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  43.41 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  40.31 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  40.99 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.5 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  43.62 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  42.34 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.24 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  42.46 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  40.86 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  41.58 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  41.07 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.51 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.51 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.12 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  42.74 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  41.97 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  41.1 
 
 		 401 aa  255  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  42.11 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  39.38 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  39.58 
 
 		 374 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.27 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  41.71 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.43 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>