More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1835 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 369 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  67.49 
 
 		 371 aa  474  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  67.13 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.46 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.46 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.1 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  65.04 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  64.93 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.71 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.73 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.84 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.3 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.42 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.7 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.53 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.7 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  57.45 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  56.3 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.41 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  44.97 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  39.55 
 
 		 357 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.17 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 366 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.61 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.61 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.66 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  43.21 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.16 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  38.32 
 
 		 365 aa  255  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.57 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.32 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  40.75 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.83 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.83 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  40.72 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.27 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41.26 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.07 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  38.84 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  40.86 
 
 		 370 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.85 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.06 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.07 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  39.13 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.91 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994.1  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1542  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0127  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3061  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3926  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.68 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.81 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.27 
 
 		 371 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.08 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  39.08 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  40.98 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  36.87 
 
 		 357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.35 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  41.89 
 
 		 584 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.71 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.2 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.26 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.21 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.17 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3003  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  40.76 
 
 		 366 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  38.04 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.22 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  40 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.86 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  38.21 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.52 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.199307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>