More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3617 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 410 aa  844    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  40.72 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.64 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.21 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  38.17 
 
 		 372 aa  225  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.76 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.98 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.43 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.13 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.13 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.61 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.35 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.35 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  36.83 
 
 		 366 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.54 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  37.39 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  33.82 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  35.67 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.93 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.83 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.13 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.12 
 
 		 368 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  35.42 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.94 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.23 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.94 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.91 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  34.52 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.82 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.02 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.14 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.9 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.9 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.53 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.55 
 
 		 359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.35 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.02 
 
 		 376 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.31 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  29.85 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  34.43 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.97 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  33.53 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.05 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.05 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.93 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  30.75 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0863  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.03 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.03 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3303  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.72 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00589278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.13 
 
 		 360 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.29 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.65 
 
 		 360 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3830  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.03 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.434299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.07 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.6 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.07 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.73 
 
 		 374 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.14 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0316  glycine cleavage system T protein  33.99 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3037  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.66 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.318867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  32.34 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3675  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.3 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.84 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3969  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.72 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  35.8 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3326  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.07 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0166736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0787  glycine cleavage system T protein  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.395738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3064  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0804  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.61058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3064  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.73 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0393389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  32.28 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.62 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.43 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.59 
 
 		 364 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0779  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.5 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3916  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.97 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  32.83 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.99 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3160  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.43 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.94655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.91 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0622  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3501  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.62 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.65276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>