More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1871 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 374 aa  755    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.9 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.1 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  58.68 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  56.98 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  56.56 
 
 		 381 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  55.43 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  54.35 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.2 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  53.89 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  54.35 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.66 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  54.37 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  54.79 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.06 
 
 		 377 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  55.43 
 
 		 370 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  53.57 
 
 		 373 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  55.28 
 
 		 370 aa  359  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.31 
 
 		 387 aa  359  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  53.95 
 
 		 374 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.2 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.36 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53 
 
 		 382 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  54.1 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  53.06 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.85 
 
 		 384 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  53.39 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  52.38 
 
 		 409 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  53.57 
 
 		 373 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.59 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.59 
 
 		 377 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  53.55 
 
 		 374 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.55 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  53.83 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  51.26 
 
 		 366 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  53.41 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.11 
 
 		 379 aa  348  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  52.46 
 
 		 391 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  53.42 
 
 		 376 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.3 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  53.44 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  52.32 
 
 		 408 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  50.68 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  52.34 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.75 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.48 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  51.49 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  51.32 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  52.32 
 
 		 376 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  53.19 
 
 		 392 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  53.23 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  52.36 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  52.83 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  53.76 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  51.77 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  54.37 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  50.83 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  52.52 
 
 		 380 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  52.69 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  52.42 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  50.68 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  49.32 
 
 		 381 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  52.3 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.48 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.2 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.17 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.9 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  43.12 
 
 		 409 aa  275  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  51.36 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.77 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  41.48 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  42.01 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 		 360 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  44.83 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  45.9 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  38.1 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.44 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.33 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.93 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  38.35 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  38.16 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.22 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  45.82 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  40.24 
 
 		 367 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  36.52 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.22 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  39.65 
 
 		 480 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.69 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.7 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  38.57 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.9 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.96 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>