More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2868 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
361 aa  735    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  58.58 
 
 
367 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  55.62 
 
 
371 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  55.07 
 
 
370 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  48.06 
 
 
365 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  47.09 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  48.77 
 
 
366 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.72 
 
 
364 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  45.03 
 
 
371 aa  329  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.24 
 
 
364 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.88 
 
 
360 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.75 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.75 
 
 
366 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  47.91 
 
 
372 aa  315  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.14 
 
 
364 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.6 
 
 
364 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  43.3 
 
 
357 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.86 
 
 
365 aa  309  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.47 
 
 
441 aa  309  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
366 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.1 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.81 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  42.86 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.06 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.06 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.06 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.97 
 
 
368 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.78 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.5 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  45.45 
 
 
366 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  44.27 
 
 
389 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.79 
 
 
363 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.68 
 
 
403 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.83 
 
 
363 aa  299  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.5 
 
 
362 aa  297  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  45.35 
 
 
367 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 
366 aa  295  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.66 
 
 
372 aa  292  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  45.48 
 
 
350 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 
362 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  44.41 
 
 
369 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  42.27 
 
 
365 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  44.01 
 
 
369 aa  289  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  43.54 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.44 
 
 
376 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  47.47 
 
 
374 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  43.67 
 
 
375 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.5 
 
 
363 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 
360 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  44.65 
 
 
381 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.68 
 
 
365 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.93 
 
 
381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.47 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.5 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.27 
 
 
359 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  45 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.77 
 
 
362 aa  281  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.06 
 
 
360 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  42.62 
 
 
381 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  44.03 
 
 
379 aa  279  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
374 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.61 
 
 
360 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.23 
 
 
369 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  43.85 
 
 
391 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.15 
 
 
375 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.5 
 
 
362 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  43.14 
 
 
361 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.93 
 
 
375 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.06 
 
 
369 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.44 
 
 
369 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.44 
 
 
369 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 
363 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.76 
 
 
365 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.5 
 
 
368 aa  268  8e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.06 
 
 
364 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.22 
 
 
372 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
368 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44 
 
 
382 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.88 
 
 
370 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.39 
 
 
363 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  41.88 
 
 
401 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 
370 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.56 
 
 
382 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  43.77 
 
 
363 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 
364 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
364 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 
381 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  40.33 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.33 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 
363 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>