More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3548 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  86.9 
 
 
387 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
374 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  68.23 
 
 
369 aa  461  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  67.22 
 
 
371 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.46 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.3 
 
 
365 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  64.23 
 
 
372 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.03 
 
 
371 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.55 
 
 
379 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.47 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  60 
 
 
372 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.83 
 
 
369 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.96 
 
 
372 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.37 
 
 
368 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  56.71 
 
 
366 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  42.62 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  45.94 
 
 
367 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
364 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  36.57 
 
 
357 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  43.44 
 
 
369 aa  255  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.16 
 
 
365 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  40.75 
 
 
375 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.76 
 
 
441 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.18 
 
 
368 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  39.06 
 
 
366 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.74 
 
 
430 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.84 
 
 
371 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 
366 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.02 
 
 
366 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
366 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.07 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.83 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.25 
 
 
366 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.95 
 
 
360 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.68 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.67 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  41.44 
 
 
366 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
363 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
363 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.23 
 
 
360 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  39.64 
 
 
410 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.29 
 
 
370 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.5 
 
 
363 aa  236  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  39.2 
 
 
370 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  38.69 
 
 
366 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.42 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.06 
 
 
364 aa  232  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.46 
 
 
367 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.87 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  43.36 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.91 
 
 
360 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.47 
 
 
372 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
372 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.94 
 
 
360 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 
362 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  40.38 
 
 
351 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.81 
 
 
359 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  35.87 
 
 
356 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  41.1 
 
 
401 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.85 
 
 
381 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.57 
 
 
365 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  38.74 
 
 
375 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  34.34 
 
 
365 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  43.56 
 
 
364 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  38.17 
 
 
371 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  37.81 
 
 
361 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.92 
 
 
363 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 
365 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.69 
 
 
370 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 
363 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  41.27 
 
 
350 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.37 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.4 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.11 
 
 
389 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.05 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
360 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.42 
 
 
369 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.24 
 
 
366 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.93 
 
 
376 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  38.81 
 
 
365 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.17 
 
 
390 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  34.63 
 
 
357 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.77 
 
 
360 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  35.73 
 
 
371 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.16 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.56 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 
360 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>