More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3132 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 371 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  78.51 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  67.13 
 
 		 369 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.03 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.5 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.43 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.19 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  63.49 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.07 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  66.39 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.33 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  61.62 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.06 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.06 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.49 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.95 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.27 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  58.58 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  46.11 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.41 
 
 		 360 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.85 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  41.22 
 
 		 375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  43.24 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.85 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.01 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  42.28 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  38.67 
 
 		 357 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  38.8 
 
 		 366 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.94 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.15 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.12 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41.14 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 366 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.56 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.54 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.29 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  36.64 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.49 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.64 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  35.91 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.31 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  41.85 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.08 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.04 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.01 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  41.36 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.25 
 
 		 366 aa  242  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  41.51 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  38.36 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.5 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.01 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.02 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  41.03 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.04 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  38.33 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.57 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.8 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  40.44 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  40.43 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1120  glycine cleavage system T protein  43.06 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  41 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.23 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  43.7 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  41.21 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 372 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.32 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.32 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.36 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  38.12 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  37.61 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  41.85 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>