More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0446 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
361 aa  744    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  46.78 
 
 
367 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.25 
 
 
366 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.52 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.13 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.96 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.96 
 
 
360 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  43.44 
 
 
365 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.43 
 
 
360 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 
364 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  44.86 
 
 
375 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 
376 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 
360 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.78 
 
 
362 aa  295  9e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  43.06 
 
 
360 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.74 
 
 
360 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.65 
 
 
369 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  40.44 
 
 
365 aa  288  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 
364 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 
381 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.11 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.06 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  43.96 
 
 
363 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.52 
 
 
374 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 
363 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 
363 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
441 aa  279  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  41.26 
 
 
364 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.39 
 
 
370 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  41.87 
 
 
366 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.94 
 
 
364 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
375 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  43.14 
 
 
361 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.18 
 
 
363 aa  276  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  41.3 
 
 
371 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  41 
 
 
378 aa  275  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.05 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.11 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.65 
 
 
372 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  41.78 
 
 
357 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  42.74 
 
 
362 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.51 
 
 
363 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.38 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  41.05 
 
 
371 aa  269  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 
363 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.4 
 
 
363 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
362 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.03 
 
 
375 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.71 
 
 
362 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
365 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41 
 
 
366 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.47 
 
 
370 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.96 
 
 
369 aa  262  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
365 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 
369 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
362 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  42.18 
 
 
351 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  41.16 
 
 
360 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 
365 aa  259  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 
363 aa  259  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 
369 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  42.47 
 
 
366 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  41.16 
 
 
363 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  42.11 
 
 
371 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  39.55 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.18 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.27 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 
430 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.59 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.99 
 
 
360 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  42.25 
 
 
350 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 
365 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.98 
 
 
371 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  41.06 
 
 
362 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
371 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 
360 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.39 
 
 
363 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.42 
 
 
389 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.59 
 
 
370 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3293  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.07 
 
 
375 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  41.42 
 
 
372 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.52 
 
 
368 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  43.06 
 
 
369 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.91 
 
 
403 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.52 
 
 
368 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  40.88 
 
 
363 aa  245  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>