More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4416 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
364 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  71.94 
 
 
360 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.28 
 
 
359 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.83 
 
 
369 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.73 
 
 
360 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.61 
 
 
369 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.05 
 
 
362 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  59.44 
 
 
360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.47 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  47.78 
 
 
357 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.43 
 
 
364 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.8 
 
 
360 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.53 
 
 
360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.53 
 
 
360 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  46.34 
 
 
375 aa  329  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.71 
 
 
360 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
441 aa  328  8e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  44.78 
 
 
365 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  46.3 
 
 
364 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.99 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.82 
 
 
368 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 
366 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 
363 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 
363 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.44 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.41 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  43.25 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  43.25 
 
 
365 aa  312  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 
366 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.08 
 
 
363 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.99 
 
 
366 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  45.15 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  44.88 
 
 
369 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 
364 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.66 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  41.87 
 
 
371 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 
364 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.13 
 
 
366 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
363 aa  299  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.5 
 
 
363 aa  294  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.65 
 
 
366 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  42.33 
 
 
389 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.48 
 
 
367 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.51 
 
 
430 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  42.47 
 
 
366 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  44.44 
 
 
350 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.03 
 
 
365 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 
362 aa  289  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.76 
 
 
365 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 
365 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
380 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
365 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.46 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 
367 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
362 aa  269  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  39.06 
 
 
361 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41.26 
 
 
361 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
370 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.71 
 
 
375 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
369 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
369 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.19 
 
 
372 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.33 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.8 
 
 
363 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.46 
 
 
376 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  40.16 
 
 
360 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  39.13 
 
 
375 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.23 
 
 
362 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  40.61 
 
 
356 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  37.27 
 
 
371 aa  260  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2576  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
364 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213671  normal  0.0237764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  40.16 
 
 
365 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  39.58 
 
 
374 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 
369 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.97 
 
 
363 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  39.5 
 
 
357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.6 
 
 
365 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
360 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
368 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.33 
 
 
372 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 
369 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  39.51 
 
 
372 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  39.13 
 
 
366 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  38.29 
 
 
364 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3037  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 
364 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.318867  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 
365 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 
360 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  39.67 
 
 
378 aa  249  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  39.2 
 
 
381 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.07 
 
 
372 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>