More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1656 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 366 aa  759    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  76.78 
 
 		 365 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  72.5 
 
 		 362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  71.04 
 
 		 365 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  70.68 
 
 		 365 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.93 
 
 		 363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.28 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  46.05 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  45.43 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  45.15 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.58 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  46.52 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.71 
 
 		 360 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  44.63 
 
 		 389 aa  311  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.43 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.15 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  44.04 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 		 367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  44.44 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  43.13 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.77 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  43.68 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.92 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  43.92 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.95 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  44.04 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  44.29 
 
 		 369 aa  289  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.11 
 
 		 360 aa  288  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.78 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  44.09 
 
 		 371 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  41.94 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.35 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.08 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  42.51 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  42.22 
 
 		 351 aa  272  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  41.64 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  41.26 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.95 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 		 362 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.92 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.07 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.23 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  41.64 
 
 		 350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.7 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.5 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  39.45 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.78 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  45.56 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  40.57 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.78 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  40 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.78 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.96 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.21 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.79 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  40.16 
 
 		 378 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.17 
 
 		 374 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.41 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  39.72 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  39.61 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  40.57 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  43.37 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.76 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.06 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3311  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.24 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.574966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.53 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.34 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0863  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3830  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.434299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3037  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.2 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.318867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  37.83 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3326  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.2 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02700  hypothetical protein  39.2 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>